"Как посчитать выборку"
Основніми способами определить размер выборки на сегодня выступают:
1. А сколько мы можем себе позолить иисходя из стоимости опроса?
2. Делаем, как все. ТОбишь берем выборку, как в аналогичном исследовании
3. Считаем нужный размер исходя из наших предположений точности исследований. Считалка для этого случая сдесь
[...]
"кого включать"
Ну теоретически это должны быть представители вашей ЦА тобишь генеральной совокупности ("топ-менеджмент, специалисты кадровых служб, отделов продаж и логистики")
"как проводить отбор"
Как хотите. Главное, чтобы респондент в выборку попадался случайным образом.
"В каком соотношении отбирать респондентов"
Для репрезентативности надобно, чтобы структура выборки соответствовала структуре генеральной совокупности.
"Рассчитывать ли выборку по базе предприятий или как-то по-другому"
Выборка зависит от размера генеральной совокупности. К ней и привязывайтесь.